Η οικονομική διαχείριση των προγραμμάτων υλοποιείται από τον ΕΛΚΕ, σύμφωνα με
τις διαδικασίες οικονομικής και διοικητικής λειτουργίας που ορίζονται στο εκάστοτε
ισχύον θεσμικό πλαίσιο και τον Οδηγό Χρηματοδότησης και Διαχείρισης του ΕΛΚΕ.
Η διαχείριση των πόρων του ΚΕΔΙΒΙΜ ΑΠΘ γίνεται από την Επιτροπή Ερευνών και
Διαχείρισης του ΕΛΚΕ του Ιδρύματος. Ο ΕΛΚΕ παρακρατεί ποσοστό 5% των εσόδων
των έργων του Κέντρου, ενώ ένα ποσοστό 10% επί των χρηματοδοτήσεων των έργων
και των εσόδων των εκπαιδευτικών προγραμμάτων του Κέντρου κατατίθενται σε
ειδικό κωδικό για την κάλυψη των γενικών εξόδων λειτουργίας του Κέντρου. Τα
παραπάνω ποσοστά παρακράτησης καθορίζονται και αναδιαμορφώνονται από τη
Σύγκλητο ανά διετία. Οι δραστηριότητες του Κέντρου πραγματοποιούνται με τη
μορφή εκπαιδευτικών έργων του ΕΛΚΕ ΑΠΘ.